随着棉花购销市场的全面放开，棉花市场多元并存，问题较多，较为突出的是棉花资源质量的人为践踏，因为竞争的不规范形成的棉市混乱等等。这些突出表现已对我国现行棉花流通体系造成极大损害，对棉花生产形成诸多影响，棉花流通体系的支离破碎，对棉花生产形成诸多影响。棉花流通是棉花产业的重要环节，其运行情况如何直接影响生产和消费。针对放开后的棉花流通现状，迅速理顺纷乱的棉花购销市场，严格规范棉花流通行为已迫在眉睫。
　　一是严格棉花市场的准入制度。虽然近年来国家也采取了一些旨在规范统一棉花流通行为的措施，如推行400T打包机，质量公检等等，但推行进度慢，施行效果甚微。现在，首要的是对现行市场进行整顿，铁腕执行棉花市场准入制度，各地可以根据地域面积产量，结合过去经过审核批准的现有收购加工企业现状，重新进行布局。在清理整顿时，以推行400T打包机和推行现代企业管理为契机，着眼于现有企业中的装备精良、资金来源有保障、市场前景好、技术力量强、管理工作搞得好，能够自觉承担社会责任为准入标准，坚决清除以坑农牟利为目的，依靠偷漏税收、投机取巧的不法棉商，积极保护依法经营，重视质量，守法经营的棉花收购加工企业。

 二是加大棉花流通在行业自律，质量监督等方面的监管力度。强化质监部门的职责功能，严格执行棉花质量法律法规，旗帜鲜明地支持那些注重长线投入，坚持质量为本，购销经营照章办事的，具有一定规模、资质的棉花企业，并通过与农民合作的形式，使之成为棉农从生产到消费的放心纽带，坚决摒弃一人食众人分，人人不饱，人人危机的哄抢作法。

　　三是对行为规范的棉花收购加工企业予以关心扶持。在棉花主产区，棉花的收购加工以及涉棉企业是当地企业的主构架，衍生企业众多，经济份额重，牵涉面广，这此涉棉企业的发展状况如何在当地影响深远。没有中小企业的发展就谈不上区域经济的发展和小康社会的建设，所以，棉花主产区支持中小企业发展的着力点应当是涉棉企业。在调查中我们发现，几乎所有的涉棉企业都受困于资金。政策性资金难争取、商业性金融机构资金盘子小、民间筹措资金不规范、风险大等等情况，令涉棉企业苦不堪言，无计可施。我们认为，棉花收购加工企业的生存状况如何很大程度上取决于资源流动的程序环境以及政府对其资金扶持的力度，而这些预期只能由政府的得力调控才能得到解决，我们建议国家重点在资金、技改两个方面对准入的具有一定收购加工能力的企业要有具体扶持措施。如贷款支持，只有已准入有资质的企业有准贷资格，对于年度收购加工在5万担以上，并承担收储任务且讲诚信，守信用的企业可优先获得贷款资格；支持企业在技术更新、设备更新等有利于产业的升级创新、产品的质量提高方面的投入支持。我们相信，经过清理整顿并得到政府、政策支持的棉花企业一定会遵循经济运行法则从事其生产经营，惠及生产与消费，而政府的亲切关怀与扶持政策的利企到位，必将是对棉花产业健康高效发展的强力助推。